在我国稻壳、酒糟、蔗渣这类纤维性副产物存量比较多，其木质纤维素结构比较稳定，单胃动物很难直接利用，所以过去这些物质大多被丢弃，生态环境因此承受了较大的负担，现在生物转化手段被用来把这些副产品做成饲料进行高值利用，这种做法已经成了主要趋势，本文依据酶的作用和菌群变化的原理，重点解析了预处理优化、好氧和厌氧结合发酵、以及工业化低能耗生产这些环节，研究发现，该工艺先让里氏木霉和黑曲霉一起协同分解，之后再衔接乳酸菌和芽孢杆菌等菌群进行顺序转化，同时再结合湿基同步干燥技术，就能打破纤维屏障，并且使成品的活菌数稳定保持在1×10⁹ CFU/g以上，当前在菌群互作机理和生产品控方面还存在一些挑战，未来需要结合多种组学技术和合成生物学方法，还要集成智能化的发酵中控系统，同时完善安全性评价，这样才能推动生物发酵饲料在多种养殖模式中规模化应用。